汉代已成村。清代曾在西南吕村西一古坟0土汉代石碑，记有南吕村名，可见成村历史久远。历史上曾称为南吕一村后因也被洪水隔为东、西二村，以方位相对而称，故名东南吕。位于该镇东南部，东北1公里余是西南召村，东南1.5公里即保兴庄村，西邻西南吕村。总面积为2.6平方公里，有人口1300多人，全村500户，耕地1970亩。
　　 1983年设立村民委员会。村民均为汉族，先祖从何处迁此定居，无考。村处平原¬，村址海拔28米。产小麦、玉米等粮食，产苹果、桃等果品。1939年曾发生大水灾，有房屋倒塌；1952年蝗灾；1970年后多旱。2008年农村经济总收入4500万元，人均纯收入6300元。
　　东南吕村附近有石花洞风景名胜区、周口店北京人遗址、房山云居寺·石经山、七渡花果山、房山十渡等旅游景点，有房山磨盘柿、北京补花、张坊磨盘柿、金北联红小豆、甜酱黑菜等特产。