南屿镇位于闽侯县南部，旗山东麓，大樟溪西畔，东隔樟溪与南通乡相望，东北与福州市南台岛相对，西南与永泰县葛岭塘前乡接壤，北连上街镇，面积170.5平方公里。下辖23个行政村、1个居民委员会，2000年计有16205户，56305人。镇政府驻地南旗村。
　　 因锦溪横贯境内，南畔为南屿而得名，北岸为北屿（亦称水西）。宋时分属侯官县修仁乡海平里、灵凤里、绥平里、迁蝗里，五芝乡闽光里，三秀里，清政里、吉壤里，西孝悌乡惠化里，扬名里。元明属三都、四都、五都、六都、七都、九都、十二都。清属三都、四都、五都、六都、七都、九都、十一都。清末为南屿区。民国29年分为镜尧乡、窗龙乡、两屿镇、芝峰乡、浦口乡，均属第三区。民国34年为南屿乡，民国37年为南屿镇属南屿区。1949年9月后属林森县第五区，1956年南屿区，1958年5月为南屿镇，9月改称南屿人民公社。1962年10月恢复区建制，1964年9月撤区并社，仍为南屿人民公社。1984年7月撤公社，设立南屿镇。.