春秋战国时为“楚尾吴头”。秦属九江郡。汉置雩娄县。隋改殷城县。宋建隆元年（公元960年）避宣祖弘殷讳，改称商城县；至道三年（公元997年）并入固始县为商城镇。明成化十一年（公元1475年）从固始析出，复置商城县。1929年商城人民举行武装起义，推毁了旧政权，建立了工农政权——县苏维埃政府。1932年初红军第三次克复商城，更县名为赤城县。1933年划商城东南半壁（约1800平方公里）归安徽建立煌县（今金寨县）。
　　明代，复置县时设乡、里。清沿明制。清末民国初，创办地方自治，改乡、里为区，下设保、甲。民国时期先区后乡，均力行保甲，苏区时期，县下设区、乡。中华人民共和国成立后，先后实行区乡（镇）、社队和乡（镇 ）村建制。明成化十五年（1475），分因始西南水丰，青峰2乡及大城乡两个里复置商城县，时设两乡32里320甲（每里10甲）。嘉靖三十一年（1551），分两乡26里，其中永丰乡统20里，青峰乡统6里。明末清初，原里计户不足当时一甲者，废而合并。清顺治四年（1647年），设东、南、西北四乡，领12里54保。宣统元年（1909）秋，创设自治研究所。二年（1910）编划区域，划县为7个区，下辖54保。城关及城郊为城区（8个保），丰集以东为康区（8个保），八里岗至银沙畈（今属金寨县）为和区（8个保），枫香树以南至汤家汇、南溪（今属金寨县）为乐区（10个保），达权店、长竹园一带为崇区（4个保），鲇鱼山以西为安区（10个保），上石桥一带为平区（6个保）。
　　民国11年（1922）秋，复办地方自治，翌年复。21年（1932）划县东南14个半保建立煌县（今安徽金寨县），将7个区并为3个区，区下设30联保，领4121甲。27年（1938）秋，日本侵略军陷商城，复为7个区。30年（1941）秋，实行乡镇自治，县划镇9年，下设151保1629甲。苏区时期，县设区、乡建制。共和国成立后，全县划为8个区。即城关区、太机枫区、峡口区人和区、双梅区、钏铺区、独山区、新生区。1950年1月，析新生区为达权店和长竹园区，全县增至9个区，下设286个乡（街）。1951年，将原9个区划为12区，以数称谓，下辖220个乡和4个街。